مهر قزاقخانه با نشان عقاب دوسر که آرم رسمی امپراتوری روسیه تزاری بود، نشانگر آن است که روس ها از آغاز، این نهاد را یک اداره روسی تلقی می کردند و قزاقخانه ایران با آن که عنوان رسمی اش«اداره بریگاد سواره قزاق اعلیحضرت همایونی»بود، عملاً هم از نظر اداری و هم از بابت آموزش، تحت فرمان صاحبمنصبان روس قرار داشت.